Zašto je pepsinu bio potreban kiseli medij za razgradnju proteina?
1. Optimalan pH za aktivnost:Pepsin ima optimalni pH raspon između 1,5 i 2,5, što je vrlo kiselo. Pri ovom pH, pepsinovo katalitičko mjesto i struktura su najstabilniji i najučinkovitiji. Kisela sredina pruža potrebne uvjete da se pepsin veže i cijepa peptidne veze u proteinima.
2. Protonacija supstrata:U kiselom mediju, kiseli uvjeti protoniraju supstratne proteine. Ovo protoniranje mijenja naboj aminokiselinskih ostataka na mjestima cijepanja, čineći ih osjetljivijima na enzimski napad pepsina. Protonirani supstratni proteini postaju pozitivno nabijeni, što pojačava njihovu interakciju s aktivnim mjestom pepsina.
3. Aktivacija pepsinogena:Pepsin se u početku proizvodi u neaktivnom obliku poznatom kao pepsinogen. Kiselo okruženje u želucu pokreće pretvorbu pepsinogena u njegov aktivni oblik, pepsin. Ovaj proces aktivacije uključuje uklanjanje inhibitornog peptida iz pepsinogena, dopuštajući enzimu da postigne svoju funkcionalnu konformaciju i započne proteolitičku aktivnost.
4. Zaštita od razgradnje:kiseli okoliš u želucu također služi za zaštitu pepsina od razgradnje drugim proteazama. Većina drugih probavnih enzima, kao što su tripsin i kimotripsin, aktivni su u neutralnijem ili alkalnijem pH rasponu. Visoko kiseli uvjeti u želucu pomažu u očuvanju stabilnosti i aktivnosti pepsina dok istovremeno sprječavaju njegovu denaturaciju ili razgradnju drugim enzimima.
Stoga je kiseli medij ključan za funkciju pepsina jer osigurava optimalni pH za njegovu aktivnost, protonira supstratne proteine, olakšava aktivaciju pepsinogena i štiti pepsin od razgradnje u želucu.
