Genotipizacija Alati
evolucija genetske tehnologije nastao iz razvoja polimeraze lančana reakcija , ili PCR . Ova metoda omogućuje istraživačima da pojača ili napraviti kopije male regije genoma nekoliko sati . Regija od interesa određuje dodavanjem kratkih molekule DNA --- klicama koje se podudaraju početak i kraj regiji interesa .
PCR je postaoneprocjenjiv alat u genetskom istraživanju . Pojačavanje istu regiju iz različitih pojedinaca daje metodu usporedbe . Identifikacija forenzika trenutno koristi 15 odvojena područja za usporedbu . Jedan regija može odgovarati na različite ljude . Međutim , ne postoje dvije osobe trebaju odgovarati svih 15 regija .
Agaroza gel elektroforeza
PCR jemetoda za pojačanje određene regije DNA . Međutim , to ne daje metodu za usporedbu stvarne veličine fragmenata . PCR proizvodi su razdvojeni po veličini pomoću gel kao materijal nazivom " agaroza . " Manji fragmenti seliti brže preko agarozom odgovor na električnu struju u procesu koji se zove " agarnom gel elektroforeza . "
Nakon PCR fragmenti su utovarena na agarozom i migriraju duž gela kad se primjenjujeelektrična struja . Etidijeva bromid omogućuje fragmenata da se vidi kada se pod ultraljubičastim svjetlom . Agaroza gel elektroforeze osigurava postupak za brzo određivanje uspješnu PCR kao približne veličine fragmenta . Međutim ,nedostatak agaroza kao alat za genotipizaciju je da fragmenti mora biti značajno različite u veličini za točne rezultate . Agaroza ne pruža dobar medij za uspoređivanje fragmente različite strane jednog bazu .
Automatizirano sekvencera i genetski Analizatori
Fluorescentno označeni DNK fragmente snimljene po automatizirani sekvencer .
Automatizirani sequencers i genetski analizatora su postaliglavni alat koristi u genotipizacija . Oni omogućuju fragmente različite strane jednog dušičnog baze , koji se određuju brzo i jeftino . Kao i kod elektroforeze na agaroznom gelu , DNA fragmenti su prvo pojačati pomoću PCR . Međutim , jedan primer označene fluorescentnom bojom dodavanjem boje fragmenta . Uzorci su razdvojeni po veličini tako migraciju kroz gel - polimera kao odgovor na električnu struju . Manji fragmenti kretati brže od većih fragmenata . Kao fragmenti migriraju prema kraju polimera ,digitalni fotoaparat bilježi boju i šalje informacije u računalo za analizu . Automatizirani sekvenciranje oprema se trenutno koristi u sudskoj identifikaciju i testiranje očinstva .
Next Generation sekvencera i odrediti genotipova
Sljedeća generacija sekvencioniranja instrumenti brzo su se pojavili tijekom od 2006 . Taj tehnologija kombinira PCR pojačanje i redoslijeda zajedno kako bi se utvrdilo milijune baza u jednom trenutku . Proces počinje s PCR; Međutim , različite početnice su dužni da perli pomiješane u jednoj reakcije omogućuje tisuće regijama biti pojačan u jednom trenutku .
Sljedeća generacija sequencers zatim odvojite fragmente po veličini i dopustitimnoštvo DNA regije koji će se analizirati . Metoda je nepovoljna kao genotipizaciju alat , kada su istraživači su zainteresirani za uspoređivanje jednu regiji genoma . Prednost je da se genom izoliran iz jedne stanice osigurava dovoljno materijala za PCR amplifikaciju . Usporedbom genotipova normalnih i abnormalnih stanica izoliranih iz jednog pojedinca može pomoći identificirati stanice raka i potencijalnih tretmana .