Protokola koji se koriste u QSAR
QSAR stoji za odnos kvantitativna struktura aktivnosti . Koristi se pokazati kakoje kemijska struktura može kvantitativno korelaciji s određenom postupku , QSAR se često koristi za izradu lijekova i droge . Ova metodologija se koristi za usmjeravanje kemijsku sintezu , jer postoje mnoge tisuće različitih mogućih struktura za jedne molekule i znanstvenicima bi inače mogli trošiti puno vremena testiranje svaki strukturu . Statistika igraju važnu ulogu u metodologiji QSAR . Višestruka linearna regresija
Višestruka linearna regresija se koristi kada postoji nekoliko studija koje su korištene sve odnose na jednu specifičnu kemijsku strukturu . Jednadžba je razvijena da , na primjer , mogu pokazati na odnos smanjenja veličine tumora i prisutnost hidrofobnu grupu na četvrtu poziciju na fenilnom prstenu . Ova analiza smanjuje mnogo različitih spojeva , takokorelacija može se tumačiti samo pomoćunekoliko parametara koji sunajvažniji .
Pattern Recognition
Prepoznavanje obrasca koristi za definiranje parametara taj rezultat , kada su određene kemijske strukture grupirani zajedno . Postoji nekoliko različitih vrsta analize raspoznavanje uzoraka , koji uključuju analize glavnih sastavnica , računalni automatizirani procjenu struktura i automatiziranu analizu podataka tehnikama prepoznavanja uzorka . Statistika prepoznavanje uzoraka korištenje izvornih podataka , te će povezati različite strukture s biološkim rezultate na temelju različitih dimenzija , od kojih je najveći biće u prvom izračunate komponente
Usporedna Molekularna analiza polja .
verzija QSAR ima djelomičnu analizom najmanjih kvadrata u paru s unakrsna validacija za stvaranje predviđanja za biološku aktivnost . U ovoj vrsti metodologije ,znanstvenik će dodijeliti posebna pravila za usklađivanje molekularne strukture . Svaka od molekula se uklopiti u mrežu , a zatim različite interakcije se izračunava na temelju interakcije sa sonde atoma na različitim mrežama . Postoji mnogo različitih jednadžbe koje mogu dovesti . Za razliku od drugih vrsta regresije , to daje jednadžbe u kojima ima puno više parametara nego moguće spojeva
Apex - . 3D
Apex - 3D koristi sustav koji automatski odabire najbolje poravnanje i konformacija za strukture na osnovi potrebne biološkog odgovora od prethodnih eksperimenata . To je moguće otkriti učinak vezanja različitih usmjerenja , antagonističke aktivnosti u odnosu na agonističku aktivnost i učinak različitih receptora . To stvara 2D i 3D topografske matrice i može generirati podatke za parova molekula , a ne pojedinačnih molekula .
Genetska Funkcija Približavanje
Genetska funkcija aproksimacija se koristi kada postoji malo uzorci i mnogo različitih varijabli pod istragom , a kad su setovi podataka nemaju linearne odnose . To koristi najbolje ocijenjeno modela i najlošije ocijenjene modela izračunate iz sirovih podataka . Ona gradi bolje i kvalitetnije modele zamjenom najgorem ocijenjeno modele . Mnoge različite više odgovara onda su pod uvjetom da znanstvenik , koji je potom odabire konačni model . Sličnosti između modela su proučavali pružiti informacije o strukturnim i biološkim korelacijama .